Meines Wissens, aber da habe ich mich nur am Rande informiert, sind Meerschweinchen unempfindlicher im Blick auf Inzucht als viele andere Tierarten. Gefährlich bis tötlich kann es aber z.B. durch unabsichtliche Paarung von zwei Schimmeln oder verdeckten Schimmeln werden oder wenn die Satin-Krankheit weitervererbt wird.
Aber da Du die Trächtigkeit ja nicht leichtfertig herbeigeführt hast, würde ich mir jetzt keine Sorgen machen. Solange Du gut informiert und vorbereitet bist und zur Not helfen bzw. zum Tierarzt fahren kannst, ist doch alles getan, was Du tun kannst.
Alles Gute!