Hallo!
Lass erst mal einen Tierarzt schauen, ob Du mit Deinen Vermutungen richtig liegst, oder ob zum Pilz gleich noch Haarlinge oder Milben kommen, Schuppen an den Innenseiten der Oberschenkel klingen danach - besser jetzt behandeln als warten bis es schlimmer ausbricht.
Ich hoffe, die Vitamin A Salbe war sehr frisch, wenn man Salben die länger als wenige Wochen an den Augen anwendet kann man damit eine Infektion provozieren.
Nachdem Du beim Tierarzt warst kann das Kleine dann zu den anderen Schweinchen. Mit Pilz dürften die klar kommen, aber Milben wäre besser wenn die vorher abgetötet sind.