Normalerweise ist es gut für die Mutter und die Jungen, wenn sie in der Gruppe bleiben! Trennen würde ich nur, wenn es wirklich Probleme untereinander gäbe, was aber nicht zu erwarten ist.
Meistens sind Geburten bei jungen Meerschweinchen problemlos. Ich würde nur Ersatzmilch bereithalten, falls Kleine dabei sein sollten, die unter 50g wiegen oder die Mutter sie nicht stillen sollte. Hast Du Dich da informiert, was Du geben kannst?
Wie ist denn die Gewichtsentwicklung bei der werdenden Mutter?