Wenn es wirklich Fliegenmaden sind, ist das extrem gefährlich für die Tiere. Fliegen legen dann gerne in die Körperöffnungen Eier und wenn daraus Maden schlüpfen, fangen sie an, das Meerschweinchen aufzufressen. Sie kriechen dabei auch in das Tier hinein.
Bitte suche die Tiere gründlich ab, vor allem aber nicht nur After und Scheide. Wenn Du am Tier Eier oder Maden findest musst Du sofort (!) zum Tierarzt. Das Tier kann sonst innerhalb von kurzer Zeit nicht mehr zu retten sein.