Das hört sich wirklich am ehesten an, als würde es ihr nicht gut gehen. Sollte sich das innerhalb von ein paar Tagen nicht bessern oder sogar zwischenzeitlich verschlechtern, würde ich zum Tierarzt gehen.
Schön, dass Nils sie dann nicht bedrängt, sondern akzeptiert, dass sie ihn abweist. Das ist ja bei 2 Schweinchen nicht einfach: Wenn einer normal das Bedürfnis nach Kontakt hat und der andere es plötzlich nicht mehr will, fehlt ja auch dem Gesunden alle Schweinchen-Nähe.
Ich würde versuchen beide besonders zu verwöhnen und ihnen Aufmerksamkeit zu geben. Gerade für Nils kann das jetzt vielleicht auch eine Hilfe sein.